Changes between Version 5 and Version 6 of TextMining

Show
Ignore:
Timestamp:
2010/02/10 01:06:23 (9 years ago)
Author:
alabarga
Comment:

--

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified
  • TextMining

    v5 v6  
    5555 
    5656This uses a W3 service (http://www.w3.org/2007/08/pyRdfa/extract) 
     57 
     58== Existing related implementations == 
     59 
     60==== Uniprot RDF ==== 
     61 
     62 
     63 http://www.uniprot.org/uniprot/P12345.n4 
     64 
     65{{{ 
     66 
     67uniprot:P12345 
     68  rdf:type Protein 
     69  alternativeName  
     70    rdf:type Structured_Name 
     71    fullName "Transaminase A" 
     72  citation <http://purl.uniprot.org/citations/4030726> 
     73    rdf:type Journal_Citation 
     74    title  
     75      "Aspartate aminotransferase isozymes from rabbit liver. Purification  
     76       and properties." 
     77    author "Kuramitsu S." 
     78    author "Inoue K." 
     79    author "Kondo K." 
     80    author "Aki K." 
     81    author "Kagamiyama H." 
     82    skos:exactMatch <http://purl.uniprot.org/medline/85289123> 
     83    skos:exactMatch <http://purl.uniprot.org/pubmed/4030726> 
     84    date 1985 
     85    name "J. Biochem." 
     86    volume 97 
     87    pages "1337-1345" 
     88    +rdf:type Citation_Statement 
     89    +scope "PROTEIN SEQUENCE" 
     90    +context  
     91      rdf:type Tissue 
     92      rdfs:label "Liver" 
     93 
     94 
     95}}} 
     96 
     97==== Pubmed RDF @ TogoWS ==== 
     98 
     99 http://togows.dbcls.jp/entry/pubmed/4030726.ttl 
     100 
     101{{{ 
     102<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#pmid>    "4030726" . 
     103<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#label>    "pmid:4030726" .           
     104<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://purl.org/dc/elements/1.1/title> "pmid:4030726" .           
     105<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://purl.org/dc/elements/1.1/identifier>    <http://pubmed.org/4030726> . 
     106<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#own>     "NLM" . 
     107<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#stat>    "MEDLINE" . 
     108<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#da>      "1985-10-09" . 
     109<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#dcom>    "1985-10-09" . 
     110<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#lr>      "2007-12-19" . 
     111<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#vi>      "97" . 
     112<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://prismstandard.org/namespaces/2.0/basic/volume>  "97" . 
     113<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#dp>      "1985 May" . 
     114<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://prismstandard.org/namespaces/2.0/basic/prism:publicationDate>   "1985-05" . 
     115<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#ti>      "Aspartate aminotransferase isozymes from rabbit liver. Purification and properties." . 
     116<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://purl.org/dc/elements/1.1/title> "Aspartate aminotransferase isozymes from rabbit liver. Purification and properties." . 
     117<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#pg>      "1337-45" . 
     118<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://prismstandard.org/namespaces/2.0/basic/startingPage>    "1337" . 
     119<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#ab>      "Cytosolic and mitochondrial isozymes of aspartate aminotransferase (L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase [EC 2.6.1.1] ) were purified to homogeneity from rabbit liver. The rabbit liver isozymes were closely similar to the corresponding isozymes from other sources, including human heart, pig heart, chicken heart, and rat liver, in their molecular weights, absorption spectra, amino acid compositions, isoelectric points, and Michaelis constants for the substrates. The NH2-terminal amino acid sequences of rabbit liver isozymes were identified up to 30 residues, and showed some differences from those of the corresponding isozymes obtained from other animals so far studied." . 
     120<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#ad>      "" . 
     121<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#fau>     "Kuramitsu, S" . 
     122<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://purl.org/dc/terms/creator>      "Kuramitsu, S" . 
     123<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#fau>     "Inoue, K" . 
     124<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://purl.org/dc/terms/creator>      "Inoue, K" . 
     125<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#fau>     "Kondo, K" . 
     126<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://purl.org/dc/terms/creator>      "Kondo, K" . 
     127<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#fau>     "Aki, K" . 
     128<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://purl.org/dc/terms/creator>      "Aki, K" . 
     129<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#fau>     "Kagamiyama, H" . 
     130<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://purl.org/dc/terms/creator>      "Kagamiyama, H" . 
     131<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#au>      "Kuramitsu S" . 
     132<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#au>      "Inoue K" . 
     133<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#au>      "Kondo K" . 
     134<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#au>      "Aki K" . 
     135<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#au>      "Kagamiyama H" . 
     136<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#pt>      "Journal Article Research Support, Non-U.S. Gov't" . 
     137<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#pl>      "JAPAN" . 
     138<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#ta>      "J Biochem" . 
     139<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://prismstandard.org/namespaces/2.0/basic/publicationName> "J Biochem" . 
     140<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#jt>      "Journal of biochemistry" . 
     141<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#jid>     "0376600" . 
     142<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#rn>      "0 (Isoenzymes)" . 
     143<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#sb>      "IM" . 
     144<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Amino Acid Sequence" . 
     145<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Amino Acids/analysis" . 
     146<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Animals" . 
     147<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Aspartate Aminotransferases/*isolation & purification/metabolism" . 
     148<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Isoelectric Point" . 
     149<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Isoenzymes/*isolation & purification/metabolism" . 
     150<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Kinetics" . 
     151<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Liver/*enzymology" . 
     152<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Molecular Weight" . 
     153<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Rabbits" . 
     154<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mh>      "Spectrum Analysis" . 
     155<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#edat>    "1985-05-01" . 
     156<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#mhda>    "1985-05-01 00:01" . 
     157<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#crdt>    "1985-05-01 00:00" . 
     158<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#pst>     "ppublish" . 
     159<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#so>      "J Biochem. 1985 May;97(5):1337-45." . 
     160<http://togows.dbcls.jp/entry/ncbi-pubmed/4030726>      <http://togows.dbcls.jp/ns/ncbi-pubmed#la>      "eng" . 
     161 
     162}}} 
     163 
     164==== Pubmed Linked Data @bio2rf ==== 
     165 
     166http://bio2rdf.org/citations:4030726 
     167 
     168{{{ 
     169 
     170http://bio2rdf.org/citations:4030726     
     171       http://bio2rdf.org/bio2rdf_resource:linkedToFrom          
     172                http://bio2rdf.org/uniprot:P12343 
     173                http://bio2rdf.org/uniprot:P12343_1 
     174                http://bio2rdf.org/uniprot:P12343_10 
     175                http://bio2rdf.org/uniprot:P12343_6 
     176                http://bio2rdf.org/uniprot:P12345 
     177                http://bio2rdf.org/uniprot:P12345_1 
     178                http://bio2rdf.org/uniprot:P12345_A 
     179        http://bio2rdf.org/bio2rdf_resource:url http://bio2rdf.org/html/citations:4030726 (Non-RDF URI) 
     180        http://creativecommons.org/ns#license   http://bio2rdf.org/license/citations:4030726 
     181        http://purl.uniprot.org/core/author      
     182                Aki K. 
     183                Inoue K. 
     184                Kagamiyama H. 
     185                Kondo K. 
     186                Kuramitsu S. 
     187        http://purl.uniprot.org/core/date       1985 
     188        http://purl.uniprot.org/core/name       J. Biochem. 
     189        http://purl.uniprot.org/core/pages      1337-1345 
     190        http://purl.uniprot.org/core/title      Aspartate aminotransferase isozymes from rabbit liver. Purification and properties. 
     191        http://purl.uniprot.org/core/volume     97 
     192        http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#type         http://bio2rdf.org/core:Journal_Citation 
     193        http://www.w3.org/2002/07/owl#sameAs    http://bio2rdf.org/medline:85289123  
     194                                                http://bio2rdf.org/pubmed:4030726 
     195 
     196}}}