Changes between Version 14 and Version 15 of GFF3toRDF

Show
Ignore:
Timestamp:
2010/02/24 00:56:57 (14 years ago)
Author:
erick.antezana
Comment:

--

Legend:

Unmodified
Added
Removed
Modified
  • GFF3toRDF

    v14 v15  
    1515 
    1616 
    17 '''Mapping (proposal)''' 
     17'''Mapping GFF2RDF (proposal)''' 
    1818 
    19 || '''GFF Element'''      || '''RDF''' || '''Example'''     || 
    20 || Column 1: "seqid"      || ?         || ?                 || 
    21 || Column 2: "source"     || ?         || ?                 || 
    22 || Column 3: "type"       || ?         || ?                 || 
    23 || Column 4: "start"      || ?         || ?                 || 
    24 || Column 5: "end"        || ?         || ?                 || 
    25 || Column 6: "score"      || ?         || ?                 || 
    26 || Column 7: "strand"     || ?         || ?                 || 
    27 || Column 8: "phase"      || ?         || ?                 || 
    28 || Column 9: "attributes" || ?         || ?                 || 
     19The following table is in a very inmature state... 
     20 
     21|| '''GFF Element'''      || '''RDF (XML)'''                      || '''Description''' || 
     22|| Column 1: "seqid"      || <gff:seqid rdf:about="#ctg123">      || ?                 || 
     23|| Column 2: "source"     || <gff:source>1000</gff:source>        || ?                 || 
     24|| Column 3: "type"       || <gff:type rdf:about="#SO:0000704">   || ?                 || 
     25|| Column 4: "start"      || <gff:start>1000</gff:start>          || ?                 || 
     26|| Column 5: "end"        || <gff:stop>9000</gff:stop>            || ?                 || 
     27|| Column 6: "score"      || <gff:score>5.8e-42</gff:score>       || ?                 || 
     28|| Column 7: "strand"     || <gff:strand>+</gff:strand>           || ?                 || 
     29|| Column 8: "phase"      || <gff:phase>.</gff:phase>             || ?                 || 
     30|| Column 9: "attributes" || <gff:attributes><rdf:Description>...</rdf:Description></gff:attributes> || ?  || 
    2931 
    3032'''Tools'''